Updating data.
[repo] / README.md
index b3bd2e4..311d69a 100644 (file)
--- a/README.md
+++ b/README.md
@@ -1,5 +1,7 @@
 # Coronavirus (Covid-19) Data in the United States
 
+**NEW:** We are publishing the data behind our [survey of mask usage](https://www.nytimes.com/interactive/2020/07/17/upshot/coronavirus-face-mask-map.html) in the United States in order to provide researchers a way to understand the role of mask wearing in the course of the pandemic. See the data and documentation in the [mask-use/](mask-use/) directory.
+
 **NEW:** We are publishing the data behind our [excess deaths tracker](https://www.nytimes.com/interactive/2020/04/21/world/coronavirus-missing-deaths.html) in order to provide researchers and the public with a better record of the true toll of the pandemic. This data is compiled from official national and municipal data for 24 countries. See the data and documentation in the [excess-deaths/](excess-deaths/) directory.
 
 ---
@@ -163,19 +165,9 @@ Sometimes, cases are first reported in one county and then moved to another coun
 
 * New York
 
-All cases for the five boroughs of New York City (New York, Kings, Queens, Bronx and Richmond counties) are assigned to a single area called New York City. There is a large jump in the number of deaths on April 6th due to switching from data from New York City to data from New York state for deaths.
-
-For all New York state counties, starting on April 8th we are reporting deaths by place of fatality instead of residence of individual. There were no new deaths reported by the state on April 17th or April 18th.
-
-On June 30, the New York City health department announced an additional 692 deaths in New York City residents, most of which had taken place outside the city more than three weeks ago. We are counting these deaths when they are in excess of the number of deaths in New York City residents counted by the state.
-
-* Georgia
+All cases for the five boroughs of New York City (New York, Kings, Queens, Bronx and Richmond counties) are assigned to a single area called New York City. The number of deaths in New York City also includes probable deaths reported by the New York City health department. Deaths are reported by county of residence, except for certain periods described below.
 
-Starting April 12th, our case count excludes cases labeled by the state as "Non-Georgia Resident" leading to a one day drop in cases. These cases were previously included as cases with "Unknown" county.
-
-* Alabama
-
-Alabama's numbers for April 17th contained an [error](https://twitter.com/ALPublicHealth/status/1251531524958289920) in reporting of lab test results that the state is working to correct. The number of deaths drops on April 23rd for an unknown reason.
+We have changed the way we have counted deaths in New York State a few times in response to changes in how the state and New York City report their data. See this [note](NEW-YORK-DEATHS-METHODOLOGY.md) for an explanation and timeline.
 
 * Kansas City, Mo.
 
@@ -203,97 +195,11 @@ Counts for Guam include cases reported from the USS Theodore Roosevelt.
 
 * Puerto Rico
 
-On April 21, the territory's health department revised their number of cases downward, saying they had been double counting some coronavirus patients in official reports, leading to a higher number of cases reported than actually confirmed. 
-
-* North Dakota
-
-On May 25, North Dakota announced that due to a laboratory equipment malfunction they were removing 82 positive results from their total case count, pending a retest of the samples.
-
-* Connecticut
-
-On May 27, Connecticut [announced](https://portal.ct.gov/Office-of-the-Governor/News/Press-Releases/2020/05-2020/Governor-Lamont-Coronavirus-Update-May-27) announced that they were removing 356 positive cases, which were determined to be duplicates, from their total case count.
-
-The number of deaths reported by the state in four counties on June 1 was anomalously high and several deaths are removed in the data for June 2.
-
-* Louisiana
-
-On May 29, Louisiana announced that due to a technical error they would not have an update on the number of total cases that day.
-
-On June 13, Louisiana reported an additional 560 backlogged cases from multiple labs and facilities from between April 25 and June 9.
-
-On June 16, Louisiana reported an additional 148 backlogged cases, the majority of which date back to mid-April.
-
-On June 19, Louisiana removed 1,666 duplicate and out of state cases from their total.
-
-* Massachusetts
-
-On April 24, Massachusetts reported the results of a large number of backlogged tests performed by Quest Diagnostics dating back to April 13, leading to a large one day jump in the number of total cases.
-
-On June 30, the number of confirmed and probable deaths declined due to Massachusetts removing duplicate reports.
-
-* Mississippi
-
-From June 18 to 21, the Mississippi State Department of Health reported technical difficulties that prevented them from updating their case and death counts.
-
-* Texas
-
-On June 16, Texas reported an additional 1,476 backlogged cases from prison inmates in Anderson and Brazoria counties.
-
-* Washington
-
-On June 17, Washington began removing from their totals deaths where Covid-19 was not a factor, for instance homicides, overdoses, suicides and car accidents. Four deaths from King County and three from Yakima county that were due to homicide, suicide or overdose were removed.
-
-#### Probable Cases and Deaths
-
-* Colorado
-
-Numbers reflect the combined number of lab-confirmed and probable cases and deaths as reported by the state. On April 25th, the state revised downward the number of deaths after removing "about 29 duplicates" from the number of "probable deaths" included in the total.
-
-* Hawaii
-
-Numbers reflect the combined number of lab-confirmed and probable cases and deaths as reported by the state.
-
-* Illinois
-
-On June 8, Illinois started reporting probable cases and deaths in their data. We are including these cases and deaths in our total numbers for the state.
-
-* Louisiana
-
-The total cases number and total deaths number include only lab-confirmed cases and deaths. The state is reporting the deaths of probable Covid-19 cases separately from their total number of deaths statewide and in each parish, and we are including those deaths in our total number of deaths for the state.
-
-* Massachusetts
-
-On June 1, Massachusetts started reporting probable cases and deaths in their data. The total number of cases and deaths on that day include probable cases and deaths going back to March 1, leading to a large one day jump in the totals.
-
-* Michigan
-
-On June 1, we began recording probable cases and deaths reported by Michigan's county and regional health districts and adding them to the individual county and statewide totals. On June 5, the state also started to report probable cases and deaths statewide, leading to a jump in total cases and deaths.
-
-* New Jersey
-
-On June 25, New Jersey began reporting probable deaths, adding 1,854 probable deaths that may date back to earlier in the outbreak to their total.
-
-* Ohio
-
-The state reports lab-confirmed and probable cases and deaths separately at the state level but combine lab-confirmed and probable cases and deaths at the county level. Our statewide and county numbers combine both case types.
-
-* Pennsylvania
-
-The total cases number includes lab-confirmed and probable cases starting around April 16th.
-
-* Virginia
-
-The state reports lab-confirmed and probable cases and deaths separately at the state level but combine lab-confirmed and probable cases and deaths at the county level. Our statewide and county numbers combine both case types.
-
-* Wisconsin
-
-Wisconsin started reporting probable cases and deaths on June 10, causing a large spike in the number of cases on that day. The total number of cases that day includes 2,407 newly reported probable cases.
-
-* Puerto Rico
+Data for Puerto Rico's county-equivalent municipios are available starting on May 5. This data was not available at the beginning of the outbreak and so all cases and deaths were assigned to Unknown.
 
-Puerto Rico reports confirmed and probable cases and deaths separately. Our statewide and municipality numbers combine both case types.
+#### Probable Cases and Deaths and Anomalies
 
-Starting April 12, the count of deaths for Puerto Rico include some probable Covid-19 related deaths. From April 19 to April 22, these were then removed. Starting April 23, the numbers again include probable deaths. We will revise these numbers as possible.
+For details on which individual state counts include probable cases and deaths and on anomalous days of data reporting, please see the list of individual state pages linked to from our [main tracking page](https://www.nytimes.com/interactive/2020/us/coronavirus-us-cases.html).
 
 ## License and Attribution
 
@@ -321,4 +227,4 @@ covid-data@nytimes.com
 
 Mitch Smith, Karen Yourish, Sarah Almukhtar, Keith Collins, Danielle Ivory and Amy Harmon have been leading our U.S. data collection efforts.
 
-Data has also been compiled by Jordan Allen, Jeff Arnold, Aliza Aufrichtig, Mike Baker, Robin Berjon, Matthew Bloch, Nicholas Bogel-Burroughs, Maddie Burakoff, Christopher Calabrese, Andrew Chavez, Robert Chiarito, Carmen Cincotti, Alastair Coote, Matt Craig, John Eligon, Tiff Fehr, Andrew Fischer, Matt Furber, Rich Harris, Lauryn Higgins, Jake Holland, Will Houp, Jon Huang, Danya Issawi, Jacob LaGesse, Hugh Mandeville, Patricia Mazzei, Allison McCann, Jesse McKinley, Miles McKinley, Sarah Mervosh, Andrea Michelson, Blacki Migliozzi, Steven Moity, Richard A. Oppel Jr., Jugal K. Patel, Nina Pavlich, Azi Paybarah, Sean Plambeck, Carrie Price, Scott Reinhard, Thomas Rivas, James G. Robinson, Michael Robles, Alison Saldanha, Alex Schwartz, Libby Seline, Shelly Seroussi, Rachel Shorey, Anjali Singhvi, Charlie Smart, Ben Smithgall, Steven Speicher, Michael Strickland, Albert Sun, Thu Trinh, Tracey Tully, Maura Turcotte, Bella Virgilio, Miles Watkins, Phil Wells, Jeremy White, Josh Williams, Jin Wu and Yanxing Yang.
\ No newline at end of file
+Data has also been compiled by Jordan Allen, Jeff Arnold, Aliza Aufrichtig, Mike Baker, Nikhil Baradwaj, Robin Berjon, Matthew Bloch, Nicholas Bogel-Burroughs, Maddie Burakoff, Christopher Calabrese, Andrew Chavez, Robert Chiarito, Carmen Cincotti, Alastair Coote, Matt Craig, John Eligon, Tiff Fehr, Andrew Fischer, Matt Furber, Ariana Giorgi, Rich Harris, Lauryn Higgins, Jake Holland, Will Houp, Jon Huang, Danya Issawi, Jacob LaGesse, Hugh Mandeville, Patricia Mazzei, Allison McCann, Jesse McKinley, Miles McKinley, Sarah Mervosh, Andrea Michelson, Blacki Migliozzi, Steven Moity, Richard A. Oppel Jr., Jugal K. Patel, Nina Pavlich, Azi Paybarah, Sean Plambeck, Carrie Price, Scott Reinhard, Thomas Rivas, James G. Robinson, Michael Robles, Alison Saldanha, Alex Schwartz, Libby Seline, Shelly Seroussi, Rachel Shorey, Anjali Singhvi, Charlie Smart, Ben Smithgall, Steven Speicher, Michael Strickland, Albert Sun, Thu Trinh, Tracey Tully, Maura Turcotte, Bella Virgilio, Miles Watkins, Phil Wells, Jeremy White, Josh Williams, Jin Wu and Yanxing Yang.